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NEXTFLEX NGS Library Preparation Kit 次世代定序建庫試劑

分類: Revvity
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穩健的文庫製備,是獲得可靠的NGS結果的關鍵步驟。Revvity 提供完整的NGS文庫製備試劑及條碼,以提高文庫製備的靈活性和速度。NEXTFLEX®文庫製備試劑,不僅可供手動使用,也能完全自動化運行於Revvity的自動化系統上。

NEXTFLEX®文庫製備試劑

文庫製備涉及理論上簡單但實際上具有挑戰性的步驟:片段化核酸的末端修復、adapter連接及片段擴增 (amplification)。這些過程都可能引起偏差,導致定序起始材料的某些片段表現不均勻。因此,為了成功地製備文庫,需要可靠的試劑來一致、準確地表達起始材料。NEXTFLEX®文庫製備試劑提供使用Illumina® 定序平台的客戶透過優化試劑來提高效率,並最大限度地減少文庫製備方案中每個步驟的偏差來實現此目標。

DNA Library Preparation Kits

  • NEXTFLEX® Rapid DNA-Seq Kit 2.0

具有簡單明暸的操作流程,能在3小時內生成一套1 ng – 1 µg 片段化 DNA文庫,其中只需1.5小時的手動操作時間;提高每個步驟的效率,生成高產量且覆蓋均勻的DNA測序文庫。在所有被認為在DNA文庫製備中至關重要的指標上,例如產量、比對率、覆蓋率和GC bias,表現與市場領先產品相當或更優。此外,本套Kit包含清理磁珠 (cleanup beads) 和條碼接頭 (barcoded adapter),作為單一lot的一部分提供,不僅提高了便利性、減少了試劑相容性的問題,並減輕了追蹤多個不同lot的負擔。

  • NEXTFLEX® Rapid XP DNA-Seq Kit v2

為enzymatic fragmentation-based Kit,通過使用Kit中包含的NEXTFLEX® Normalization Beads,可以在不需要傳統標準化 PCR步驟的情況下產生一致的結果。週轉時間僅為2.5小時,大大減少了標準化所需的成本和時間。

RNA Library Preparation Kits

  • NEXTFLEX® Rapid Directional RNA-Seq Kit with Poly(A) Beads 2.0

能生成具有高覆蓋均勻性、低重複率、超過99%鏈特異性和最少rRNA污染,適用於 Illumina® 測序的文庫,並能以total RNA做為輸入。本Kit包含逆轉錄酶 (reverse transcriptase)、必要的文庫製備試劑以及經過優化以確保可靠性能的清理及大小選擇磁珠,減少移液並消除耗時的步驟。

此外,Kit可搭配NEXTFLEX® barcodes使用:NEXTFLEX® barcodes為經過色彩平衡設計並通過專有純度質控指標,用以確保每個樣本的測序結果可靠。並且可進行無凝膠尺寸選擇,從而實現高通量、多重定序。非常適合>150 bp 的插入片段。

  • NEXTFLEX® Small RNA-Seq Kit v4

使用申請專利的技術,為Illumina®測序平台提供了一個完全無需凝膠的small RNA文庫製備解決方案。通過優化連接反應 (ligation reaction) 和使用二聚體 (dimer) 減少寡核苷酸 (oligonucleotide) 來降低偏差。使用本Kit能夠在約5小時內以簡化的工作流程製備好測序所需的文庫,具有更高比例的比對讀數 (proportion of mapping reads) 和獨特miRNA,且起始量僅需1 ng的 total RNA。

Amplicon Library Preparation Kits

Amplicon library 是指通過擴增子技術(amplicon technology)生成的一組DNA片段文庫。這些片段通常是由聚合酶鏈式反應(PCR),針對基因組中特定的DNA區域進行擴增。這些區域通常是與疾病相關的基因、微生物16S rRNA基因、免疫基因組(如TCR或BCR)等。應用於NGS技術中,可對特定基因區域或序列進行深入分析。

NEXTFLEX® Amplicon-Seq 試劑盒旨在製備跨越微生物 16S 核醣體 RNA (rRNA) 基因高變異域的多重擴增子文庫。這些文庫與 Illumina® MiSeq 平台相容。擴增子處理涉及兩個主要步驟:使用針對特定結構域的客製化PCR 引子進行初始PCR 擴增,以及整合相關流動池結合結構域和獨特的12 個鹼基對樣本索引的後續PCR 擴增。有限數量的清理步驟可確保最大程度地回收用於下游定序的擴增子,且不需要客製化定序讀取引子。

  • NEXTFLEX® 16S V1-V3 Amplicon-Seq Kit
  • NEXTFLEX® 16S V4 Amplicon-Seq Kit 2.0
  • NEXTFLEX® 16S V3-V4 Amplicon-Seq Kit

NEXTFLEX®可相容之自動化儀器

 

Next Generation Sequencing (NGS) is being used to not only analyze more samples but also to analyze more challenging samples, for example low quality or small samples. The NGS workflow steps include sample homogenization, nucleic acid extraction, library preparation, and quality control of input DNA/RNA/NGS libraries. Robust library preparation is a critical step to obtain reliable results in NGS. Revvity provides a complete portfolio of NGS library preparation kits and barcodes designed to increase the flexibility and speed of library prep.

The NEXTFLEX® library preparation kits are available for manual use and are also fully automated on Revvity’s liquid handlers. We have focused our attention on improving the enzymatic and automation efficiencies offered by our library prep solutions to cater to our customers’ needs for cost-effective solutions to achieve robust sequencing results.

 

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