MiniPunch^®

產品定位：銜接組織型態與分子證據，賦能轉譯醫學研究

轉譯醫學研究的核心挑戰之一，在於如何將病理組織的形態學判讀（例如腫瘤區、免疫細胞浸潤區、特定病灶）與分子層級的基因表現、突變或蛋白質數據精確對應。傳統作法多仰賴病理醫師以肉眼或顯微鏡標記蠟塊區域，再由操作人員以手動方式刮取或以生檢針取樣，此過程容易因視野偏移、標記誤判或操作差異而導致取樣區域與原始標註不完全吻合，進而影響下游分子數據的可解釋性與重現性（reproducibility）。

MiniPunch® 的設計邏輯，是將數位病理玻片上的標註（annotation）與實體蠟塊影像進行自動疊合定位，讓研究人員在螢幕上選定的取樣點，能以 200 µm 精度直接對應至蠟塊上的實際物理位置，並以單一針具完成單次取樣、沉降至收集管的完整流程。這種「所見即所取」的設計，特別適合需要進行空間分子分析（spatially resolved molecular analysis）、腫瘤異質性研究、或需將 IHC／H&E 染色結果與基因體、轉錄體數據交叉比對的 R&D 專案。

自動化工作流程：從數位玻片標註到分子級分注

MiniPunch® 的操作流程由 MiniPunch® Software 逐步引導，涵蓋玻片標註、蠟塊裝載、AI 影像疊合與取樣點確認、以及自動化取芯與分注四個階段。每個階段皆有明確的預估耗時，方便研究團隊規劃批次處理排程；其中蠟塊與玻片影像的疊合運算由內建演算法完成，取樣點的最終確認則保留人工複核（manual coring point selection）的彈性，兼顧自動化效率與研究人員對取樣決策的最終把關。以下為四階段的具體內容：

1. 標註玻片、建立專案

於 Excilone®View 或 Excilone®View Web 標註數位玻片，並建立取樣專案。
約 1 分鐘/玻片，1–5 分鐘/專案

2. 裝載蠟塊

將 FFPE 蠟塊或厚組織切片固定於自動化載盤。
約 2 分鐘

3. AI疊合與取樣點確認

AI 演算法自動疊合標註玻片與蠟塊影像，並由人工複核確認取樣點。
疊合約 1–20 分鐘/盤，取樣點確認約 1–10 分鐘/盤

4. 自動取芯與分注

自動於蠟塊取芯，並將樣本轉移至收集管。
約 40 秒/樣本

AI 精準取樣：以演算法對位確保取樣重現性

MiniPunch® 軟體透過人工智慧演算法，自動將已標註之數位玻片影像與蠟塊表面影像進行疊合比對，讓使用者於 Excilone®View 或 Excilone®View Web 上定義的標註區域，能自動映射至蠟塊實體座標。對位過程完成後，系統同時提供簡易的手動微調工具（manual overlap），供使用者針對疊合結果進行局部校正，兼顧自動化效率與人工判斷的彈性。

取樣針具的直徑為 200 µm，此規格使 MiniPunch® 能針對特定細胞亞群（cell subpopulation）或精細組織區域進行高精度取樣，相較於傳統以肉眼定位的手動刮片或穿刺取樣，可大幅提升取樣區域與原始病理標註之間的空間一致性，是支持腫瘤異質性分析、免疫微環境研究等高解析度轉譯醫學專案的關鍵能力。

文件化與可追溯性：從樣本到報告的完整稽核軌跡

在轉譯醫學與生物標記（biomarker）研究中，實驗數據的可重現性與可稽核性，往往與取樣當下的完整紀錄同等重要——尤其當研究涉及跨團隊協作、多中心生物庫（biobank）樣本共用，或後續需回溯特定分子結果對應之原始組織區域時，缺乏系統化文件紀錄的取樣流程，將使數據品質難以被驗證，也不利於後續的方法學審查或論文發表時的材料方法（Materials and Methods）陳述。

MiniPunch® 針對此需求，在每一次取樣流程中內建多層次的自動化紀錄機制：系統會擷取蠟塊識別碼（block identifier）之影像，並可讀取條碼（barcode reading）以連結樣本身份；蠟塊影像在取樣前、後皆會分別擷取存證，確認取樣位置與蠟塊完整性；樣本沉降至收集管後，系統再擷取一次收集管內影像，作為樣本確實完成分注之佐證。此外，系統亦會記錄每一蠟塊的厚度量測數據，作為取芯深度設定與品管參數的依據。

上述影像與資料的逐步留存，形成一條從「數位玻片標註」到「實體樣本分注」的完整稽核軌跡（audit trail），有助於研究團隊在內部品保審查、跨機構資料交換，或申請 GLP／法規銜接性研究前的資料完整性準備工作中，提供可回溯、可驗證的原始紀錄基礎。需注意的是，MiniPunch® 為 RUO 研究用儀器，其文件化機制設計目的在於支持研究資料的可追溯性與重現性，並不等同於符合特定法規（如 21 CFR Part 11）之電子紀錄合規聲明，實際適用性仍應由使用單位依其法規需求自行評估。

研究應用觀點：對於需長期保存樣本鏈紀錄（chain of custody）的生物庫管理、跨團隊分工的大型轉譯研究計畫，或需將分子數據回溯連結至原始病理判讀的迴溯性研究，MiniPunch® 逐步影像存證的設計，可作為實驗記錄本（lab notebook）之外的補充性佐證資料來源。

分子完整性保護與組織典藏

MiniPunch® 採用單次使用針具（single-use needle）設計，每次取樣皆更換全新針具，避免不同蠟塊之間、或同一蠟塊不同區域之間的交叉污染（cross-contamination）。所有針具出廠時皆為 RNase 及 DNase free，有助於降低取樣過程中核酸降解的風險，對於後續進行 RT-qPCR、RNA-seq、NGS 或其他對核酸完整性敏感的下游分析尤為重要。

由於單次取樣僅移除蠟塊上直徑 200 µm 之微量組織，相較於傳統整塊切片或大範圍刮取的取樣方式，MiniPunch® 對原始蠟塊的破壞性顯著較低，使珍貴的臨床或研究用組織檢體得以保留供後續其他分析項目使用，此點對於樣本來源有限的稀有病例、長期追蹤世代研究（cohort study）或多次分子檢測需求的專案而言，具有實質的樣本保存價值。

大容量設計與耗材相容性

為配合中大型研究批次的處理需求，MiniPunch® 配備自動化載盤，單一批次最多可容納 16 個 FFPE 蠟塊，並可搭配 96 孔盤（96-well plate）或條管架（strip tube rack）作為收集容器，另設有專屬針具架插槽。載盤採馬達驅動設計，蠟塊、微量盤與針具架之裝卸皆透過機構定位完成，操作介面以觸控螢幕為主，並隨附鍵盤與滑鼠（收納於機身底部抽屜）作為輔助輸入。蠟塊固定機構與微量盤支架皆可拆卸，便於清潔維護，軟體並提供逐步引導，降低操作訓練門檻。

註：收集容器相容規格綜合原廠 2025 年 3 月版技術文件與 2025 年 5 月版產品型錄；型錄版本新增 0.5 mL 微量管相容性，實際可用容器組合請於下單前向博克科技確認最新原廠規格。

應用領域與分子萃取工作流程

MiniPunch® 取得之組織芯可直接進行分子萃取，且流程中不需經過傳統的脫蠟（dewaxing）前處理步驟，可同時支援 DNA、RNA 與蛋白質三類分子標的之後續分析，包括以 RT-qPCR、RNA-seq 進行基因表現分析（gene expression profiling）；以 PCR、qPCR、dPCR 或 NGS 進行基因突變檢測（gene mutation analysis）；以及以質譜（mass spectrometry）等技術進行蛋白質層級分析。此一免脫蠟工作流程，有助於縮短樣本前處理時間，並降低前處理步驟中可能引入的變異來源。

在應用領域方面，MiniPunch® 適用於免疫學（Immunology）、神經病理學（Neuropathology）、腫瘤學（Oncology）及感染病學（Infectiology）等領域之研究，特別適合需要將特定組織區域（如腫瘤核心、浸潤邊緣、特定病灶）之形態學資訊與分子數據建立精確對應關係的研究設計，是 R&D 團隊於空間分子病理學（spatial molecular pathology）與轉譯醫學專案中，銜接病理判讀與分子檢測的實用工具。

技術規格

以下規格整理自 Excilone SARL 官方技術文件（Technical offer description V2，2025 年 3 月版）及產品型錄（2025 年 5 月版），涵蓋硬體規格、環境需求與內建電腦規格三個面向。原廠聲明規格於出貨時可能因產品持續改良而略有調整，正式報價與交機前請以博克科技提供之最新原廠文件為準。

硬體規格

環境需求

內建電腦與軟體規格

＊上述規格可能於原廠交機時略有調整，恕不另行通知，正式報價請洽博克科技確認。

訂購資訊與服務保固

MiniPunch® 標準配備涵蓋主機、鍵盤滑鼠、電源線（依國家提供對應規格）、蠟塊取出工具、內含 96 孔針具之針具架、MiniPunch® 控制軟體及使用手冊，以及 Excilone®View 軟體授權與使用手冊（可讀取主要數位玻片掃描機廠牌之虛擬玻片並進行標註）。日常耗材以針具架為主，詳見下表；如需其他訂購資訊或客製化配置，請洽博克科技業務窗口確認最新報價與到貨時程。

耗材品項

其餘配件或訂購項目之貨號，如未於原廠文件中列出，請洽博克科技確認。

安裝與保固服務

Excilone 在數位病理領域累積超過 15 年經驗，MiniPunch® 購入後之標準服務內容包括：安裝確效（Installation Qualification, IQ）、操作確效（Operational Qualification, OQ）、操作人員教育訓練，以及自安裝確效證明日期起算之 1 年儀器保固（於正常使用範圍內，詳細條件請參閱使用手冊）。硬體與軟體產品皆享 1 年瑕疵保固；軟體產品於保固期間內可享免費更新，保固期滿後可另行簽訂維護合約以持續取得軟體更新服務。

本系列為 Research Use Only（RUO）研究用途，非 IVD 醫材，不屬台灣 TFDA 醫療器材查驗登記範圍。安裝確效、操作確效與保固條件之最終適用範圍，請以原廠正式文件與博克科技提供之服務合約為準。

常見問題